遺伝情報実験センターで利用できるデータベース

遺伝情報実験センターでは、核酸、蛋白質などの配列データを中心にして種々のデータベースを常に最新の状態に保って、ユーザーに提供しています。現在提供されているデータベース以外に是非必要なデータベースがある場合は、システム管理者まで申し出て下さい。

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核酸配列データベース

• GenBank
  Growth of GenBank
  (Rel.217 of 15-Dec-2016 更新日付：2017年1月11日)
• EMBL
  (Rel.130 of 13-Nov-2016 更新日付：2017年1月12日)
• DDBJ
  (Rel.107 of 25-Nov-2016 更新日付：2017年1月11日)
• NCBI BLASTDB

アミノ酸配列データベース

• UniProt
  (UniProt Rel.2017_01 [ Swiss-Prot Rel.2017_01, TrEMBL Rel.2017_01 ] of 18-Jan-2017 更新日付：2017年1月30日)
• PIR
  (Rel.80.00 of 31-Dec-2004 更新日付：2005年1月25日)
• NR-AA(PIR+SwissProt)
  (更新日付:1998年7月22日)

アミノ酸モチーフデータベース

• PROSITE
  (Rel.13 of Nov-1995 更新日付：1996年1月12日)

蛋白質立体構造データベース

• PDB
  (Protein Data Bank)（更新日付：2009年1月16日）
  
  • X-ray diffraction:47132, NMR:7627 other:313