第5回
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開始行:
*生物情報科学 第5回 [#u58b7ee9]
**遺伝情報実験センター開発のマルチプルアライメントエディ...
+http://www.gen-info.osaka-u.ac.jp/geneweb2/genealign/wel...
+さきほどダウンロードした GeneAlign20071108_clustalw2.1-w...
+GeneAlignが動くことを確認する。各自の「linuxhome」内の「...
+（余談）GeneAlignはCentOSなどLinuxでも動作する。このため...
**GeneAlignを使ってみる。 [#zd3b94a8]
具体的には、授業で指示する。
+ &ref(pol.fst); をダウンロードして linuxhome に保存。
+ pol.fst を GeneAlignで開く。
+ "Select All"を押してから、アライメントのアイコンを押す...
+ 気に入らないところがあれば、手動で訂正する。（マウス左...
+ File→Save As にて、pol_align.fst というファイル名で別名...
**サンプルデータを使った演習 [#o78f0128]
具体的には、授業で指示する。
+[[GeneWeb3のサンプルデータ:http://www.gen-info.osaka-u.a...
+一部のブラウザではファイル名が指示どおりにならないので、...
+haemoglobin.fst を GeneAlign で開く。
**付録: トラブル発生時の対策 [#a985a181]
注意: 以下は「&color(#ff6600){ディスクを全然使っていない...
Linux上でclustalwのアイコンをダブルクリックした場合に、表...
操作内容は別ページ「[[トラブル発生時の対策]]」を参照する...
終了行:
*生物情報科学 第5回 [#u58b7ee9]
**遺伝情報実験センター開発のマルチプルアライメントエディ...
+http://www.gen-info.osaka-u.ac.jp/geneweb2/genealign/wel...
+さきほどダウンロードした GeneAlign20071108_clustalw2.1-w...
+GeneAlignが動くことを確認する。各自の「linuxhome」内の「...
+（余談）GeneAlignはCentOSなどLinuxでも動作する。このため...
**GeneAlignを使ってみる。 [#zd3b94a8]
具体的には、授業で指示する。
+ &ref(pol.fst); をダウンロードして linuxhome に保存。
+ pol.fst を GeneAlignで開く。
+ "Select All"を押してから、アライメントのアイコンを押す...
+ 気に入らないところがあれば、手動で訂正する。（マウス左...
+ File→Save As にて、pol_align.fst というファイル名で別名...
**サンプルデータを使った演習 [#o78f0128]
具体的には、授業で指示する。
+[[GeneWeb3のサンプルデータ:http://www.gen-info.osaka-u.a...
+一部のブラウザではファイル名が指示どおりにならないので、...
+haemoglobin.fst を GeneAlign で開く。
**付録: トラブル発生時の対策 [#a985a181]
注意: 以下は「&color(#ff6600){ディスクを全然使っていない...
Linux上でclustalwのアイコンをダブルクリックした場合に、表...
操作内容は別ページ「[[トラブル発生時の対策]]」を参照する...
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![[PukiWiki]](image/pukiwiki.png "[PukiWiki]")
