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*生物情報科学 第7回 [#gc930db4]
(このページは準備中です。特に、レポート課題は変更するかも...
**A型インフルエンザの系統樹を描いてみよう。 [#k7173e7f]
+今回の実習はWindowsで行う。
+A型インフルエンザのヘマグルチニン(HA)遺伝子のサンプル配...
+flu_nucleotide.fstの各配列のコメント行（">"で始まる行...
+前回使用した GeneAlign を用いて、HA遺伝子配列のアライメ...
+アライメント結果を「flu_nucleotide_aln.fst」という名前で...
+MEGA4 を使って flu_nucleotide_aln.fst の系統樹を作成する。
+Mega を起動してメインウインドウに先ほど保存した「flu_nuc...
&ref(megaMain.png);
+新しいウインドウが開いたら、新しく開いたウインドウを閉じ...
&ref(megaAlignExplo.png);
+セーブするかどうか聞いてくるので、Yes をクリックして、fl...
&ref(megaSaveMega.png);
+タイトルを入力するように催してくるが何も入力せずにOKを押...
&ref(megaTitle.png);
+タンパク質をコードする配列かどうか聞いてくる。今回は塩基...
&ref(megaOpenMega.png);
+新しいウインドウが開くが無視して、メインウインドウの「Ne...
&ref(megaNJmethod.png);
+設定を確認するウインドウが出るので、確認して、Compute を...
&ref(megaNJexec.png);
**構築したA型インフルエンザに新型インフルエンザのデータを...
+新型インフルエンザの配列&ref(new_H1N1_HA.fst);をダウンロ...
+新型インフルエンザは、どの株と最も近縁であるか？また、こ...
(レポート課題は変更するかもしれないので、授業中の指示があ...
終了行:
*生物情報科学 第7回 [#gc930db4]
(このページは準備中です。特に、レポート課題は変更するかも...
**A型インフルエンザの系統樹を描いてみよう。 [#k7173e7f]
+今回の実習はWindowsで行う。
+A型インフルエンザのヘマグルチニン(HA)遺伝子のサンプル配...
+flu_nucleotide.fstの各配列のコメント行（">"で始まる行...
+前回使用した GeneAlign を用いて、HA遺伝子配列のアライメ...
+アライメント結果を「flu_nucleotide_aln.fst」という名前で...
+MEGA4 を使って flu_nucleotide_aln.fst の系統樹を作成する。
+Mega を起動してメインウインドウに先ほど保存した「flu_nuc...
&ref(megaMain.png);
+新しいウインドウが開いたら、新しく開いたウインドウを閉じ...
&ref(megaAlignExplo.png);
+セーブするかどうか聞いてくるので、Yes をクリックして、fl...
&ref(megaSaveMega.png);
+タイトルを入力するように催してくるが何も入力せずにOKを押...
&ref(megaTitle.png);
+タンパク質をコードする配列かどうか聞いてくる。今回は塩基...
&ref(megaOpenMega.png);
+新しいウインドウが開くが無視して、メインウインドウの「Ne...
&ref(megaNJmethod.png);
+設定を確認するウインドウが出るので、確認して、Compute を...
&ref(megaNJexec.png);
**構築したA型インフルエンザに新型インフルエンザのデータを...
+新型インフルエンザの配列&ref(new_H1N1_HA.fst);をダウンロ...
+新型インフルエンザは、どの株と最も近縁であるか？また、こ...
(レポート課題は変更するかもしれないので、授業中の指示があ...
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