BLAST Matrix

Query data

Nucleotide
Protein
Other (fill advanced option)

query region (X axis): -

data region (Y axis): -

max number of plots:

show me plot data in m8 like format

advanced option .. about options

See sample data for nucleotide or amino acid sequence

・BLASTを使用した高速なホモロジーマトリックス描画プログラムです。
・メガベースペアくらいまでは高速に描画可能です。
・入力配列には multifasta format で2本の配列を入力してください。
・順方向にヒットしているときは赤色、相補鎖とヒットしている場合には緑色の 線を描きます。また、ヒットした identity が低いほど暗くうすい色に表示されます。
・リクエストにお応えして、ホモロジーマトリックスと共に アライメント結果も出力するようにしました。